A investigação na ESTiG tem vindo a crescer, tanto ao nível qualitativo como quantitativo. Atualmente, integram o ecossistema de investigação da ESTiG: o Centro de Investigação de Montanha (CIMO), o Centro de Investigação em Digitalização e Robótica Inteligente (CeDRI), a Unidade de Investigação Aplicada em Gestão (UNIAG) e GICoS (Grupo de Investigação em Construção Sustentável).